Les zones d’interventions sont spacieuses et éloignées l’un de l’autre et surtout éloignées du siège. Faute de moyen de déplacement et moyen financier, le manque de communication entre l’équipe de terrain et du siège, l’absence de la direction aux réunions de coordination et au suivi, le quasi désorganisation des membres de l’équipe de terrain sont ressentis. CODE Menabe n’a pas de ressources propres autres que les cotisations des membres, alors qu’elle a d’autres objectifs à atteindre qui ne coïncident pas à ceux des partenaires.

Outre le manuel de procédures administratives et financières, CODE renforce ses règlementations. En 2024, CODE Menabe dispose un manuel de Subgrant régissant ses bénéficiaires de sous-subvention soit individuel ou soit organisation ; des conventions collectives pour la gestion des ressources humaines. Chaque personnel a signé le code de conduite cadré par le code de travail.